Így néz ki működés közben:

Maga a Tux Paint a tuxpaint.exe indítható el, de van külön egy beállításra szolgáló exe is: tuxpaint-config.exe
A beállítások között talán a legfontosabbak a "Video/Sound" lapon vannak:
"Fullscreen": teljes képernyős működés
"Window size": a Tux Paint ablakának mérete
"Enable §ound Effects": hang effektek ki / be kapcsolása
A "Printing" lapon a nyomtatás engedélyezhető, vagy tiltható.
De amúgy számos beállítás módosítható. Ha minden megvan, akkor "Apply". Ha a Tux Paint futott közben, akkor újra kell indítani a beállítások érvényre jutásához.